MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 1353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	AAC	2	6	32	37	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017657	GGA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	CAT	2	6	47	52	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
4	NC_017657	TC	3	6	98	103	0 %	50 %	0 %	50 %	387504845
5	NC_017657	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504845
6	NC_017657	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504845
7	NC_017657	CAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
8	NC_017657	AC	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	387504845
9	NC_017657	ACGG	2	8	456	463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017657	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017657	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017657	TGTAC	2	10	500	509	20 %	40 %	20 %	20 %	387504846
13	NC_017657	GTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504846
14	NC_017657	ACG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504846
15	NC_017657	GAA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
16	NC_017657	GGCA	2	8	789	796	25 %	0 %	50 %	25 %	387504846
17	NC_017657	GAA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
18	NC_017657	GCG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017657	CAC	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017657	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017657	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017657	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017657	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017657	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017657	CG	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017657	GGAAG	2	10	1176	1185	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017657	T	7	7	1242	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017657	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017657	TCCTCT	2	12	1300	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017657	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017657	CGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017657	GCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017657	GTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504847
35	NC_017657	GAT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504847
36	NC_017657	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	CGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
38	NC_017657	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504848
39	NC_017657	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504848
40	NC_017657	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
41	NC_017657	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504848
42	NC_017657	CTGA	2	8	1944	1951	25 %	25 %	25 %	25 %	387504848
43	NC_017657	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
44	NC_017657	CTG	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
45	NC_017657	TGA	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017657	TTG	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017657	GGGA	2	8	2179	2186	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017657	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017657	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504849
50	NC_017657	GAT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
51	NC_017657	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
52	NC_017657	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504849
53	NC_017657	TGA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
54	NC_017657	ATG	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
55	NC_017657	GAT	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
56	NC_017657	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
57	NC_017657	ATA	2	6	2735	2740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
58	NC_017657	GAAA	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	387504849
59	NC_017657	ATTT	2	8	2783	2790	25 %	75 %	0 %	0 %	387504849
60	NC_017657	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504849
61	NC_017657	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
62	NC_017657	GTAA	2	8	3071	3078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017657	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017657	TTC	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017657	GTC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017657	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017657	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017657	TA	4	8	3234	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017657	CGC	2	6	3480	3485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
70	NC_017657	CGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
71	NC_017657	TGG	3	9	3517	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504850
72	NC_017657	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
73	NC_017657	GCC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
74	NC_017657	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
75	NC_017657	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
76	NC_017657	CGG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
77	NC_017657	CCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504850
78	NC_017657	CTG	3	9	4011	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
79	NC_017657	CTGC	2	8	4056	4063	0 %	25 %	25 %	50 %	387504850
80	NC_017657	GAA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
81	NC_017657	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
82	NC_017657	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
83	NC_017657	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
84	NC_017657	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
85	NC_017657	AGG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504850
86	NC_017657	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504850
87	NC_017657	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	387504850
88	NC_017657	GCG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
89	NC_017657	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
90	NC_017657	CCGCT	2	10	4669	4678	0 %	20 %	20 %	60 %	387504850
91	NC_017657	CAGT	2	8	4716	4723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017657	TG	4	8	4746	4753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017657	TTC	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504851
94	NC_017657	TCTGGT	2	12	4928	4939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387504851
95	NC_017657	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
96	NC_017657	ATA	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504851
97	NC_017657	TGT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504851
98	NC_017657	TGGCA	2	10	5258	5267	20 %	20 %	40 %	20 %	387504851
99	NC_017657	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
100	NC_017657	AAT	2	6	5344	5349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017657	TGG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017657	CAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017657	CAC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017657	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017657	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017657	ACA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017657	GTA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017657	A	6	6	5571	5576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017657	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017657	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017657	GCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017657	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017657	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017657	TTTAT	2	10	5698	5707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017657	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017657	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
117	NC_017657	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
118	NC_017657	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504852
119	NC_017657	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
120	NC_017657	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504852
121	NC_017657	CTT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
122	NC_017657	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
123	NC_017657	TC	3	6	5993	5998	0 %	50 %	0 %	50 %	387504852
124	NC_017657	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
125	NC_017657	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	387504852
126	NC_017657	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
127	NC_017657	TGA	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
128	NC_017657	ATTA	2	8	6187	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017657	ATTTGA	2	12	6216	6227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017657	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017657	CAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504853
132	NC_017657	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504853
133	NC_017657	ATTT	2	8	6418	6425	25 %	75 %	0 %	0 %	387504853
134	NC_017657	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	387504853
135	NC_017657	AG	3	6	6495	6500	50 %	0 %	50 %	0 %	387504853
136	NC_017657	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504853
137	NC_017657	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017657	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017657	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017657	AGA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017657	TGA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017657	TTC	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017657	ATC	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017657	ATG	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017657	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017657	ACT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017657	TAA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017657	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017657	ATT	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017657	TAA	2	6	6986	6991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017657	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017657	TTTA	2	8	7018	7025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017657	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017657	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017657	AAG	2	6	7559	7564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017657	T	7	7	7568	7574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_017657	ATA	2	6	12001	12006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_017657	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017657	TAT	2	6	12507	12512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_017657	ATTA	2	8	13201	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017657	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_017657	TGG	2	6	13444	13449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504865
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272	NC_017657	TCT	2	6	13520	13525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504865
273	NC_017657	TGG	2	6	13637	13642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504866
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